我們現在使用的臭氧機器是一種裝置，通過空氣泵吸入空氣，將空氣分解產生臭氧，然后將臭氧注入水族箱。正確使用臭氧可以殺死氣瓶中不需要的有害細菌和病原體，分解氨和有機廢物，并將氧化還原潛能(氧化還原潛能)提高到合理值。
使用臭氧時，由于臭氧首先需要溶解在水中，所以不能直接注入水族箱主水箱的水中。最好將臭氧添加到單獨的水箱中，如蛋白質分離器，然后流入主缸。當使用淡水罐時，臭氧機也與氧氣泵連接，與氣體混合，然后注入單獨的水槽，流入主缸以增加臭氧。
臭氧的使用量因水族館而異。海水中臭氧的使用通常與蛋白質分離器相連，因為雞蛋產生的細小氣泡能更好地溶解臭氧，而且細氣泡的臭氧效應將加倍。
1.臭氧機電極對高濕空氣很弱，大大縮短了使用壽命。為了保證臭氧機在干燥空氣中工作，還相互配合使用空氣壓縮機，使其使用壽命比紫外線燈長得多。
2.含有臭氧的海水和空氣對魚類和人體有害，活性炭可用于吸收過量的臭氧。臭氧機包括汽缸，最好與使用時配合放置活性炭和臭氧機，以防止鋼瓶中過量的臭氧殘留物。
